Στη διαδικασία της παράτασης κρίθηκε ο τελικός που φιλοξενήθηκε στις 13.05.2006 στο Στάδιο ΓΣΖ.
Για τον ΑΠΟΕΛ σκόραραν οι Νεοφύτου 15΄, Κακλαμάνος 17΄ και Γιοβάνοβιτς 107΄και για την ΑΕΚ οι Σισέ 19΄ και Ραντουκάν 42΄.
Τον αγώνα παρακολούθησαν 11 χιλιάδες θεατές και διαιτήτευσε ο Στέλιος Τρύφωνος.
ΑΠΟΕΛ (Γέρσι Έγκελ): Μιχάλης Μορφής, Μάριος Ηλία, Γιάροσλαβ Ποπιέλα (91΄ Αλεξάντερ Τοντορόσκι), Δημήτρης Δασκαλάκης, Μαρίνος Σατσιάς, Χρύσης Μιχαήλ, Νεκτάριος Αλεξάνδρου (76΄ Σάσα Γιοβάνοβιτς), Κωνσταντίνος Μακρίδης, Αλέκος Κακλαμάνος, Μάριος Νεοφύτου (59΄ Εστεβάν Σολάρι), Ρικάρντο Φερνάντες.
ΑΕΚ (Μάριος Κωνσταντίνου): Παναγιώτης Κυθρεώτης, Κωνσταντίνος Μηνά, Παρασκευάς Χρίστου, Χάρης Σιλιγαρδάκης, Ζε Νάντο, Αζουμπούικε Όλισε, Τζάτο Σισέ, Ναρκίς Ραντουκάν (87΄ Πέδρο Μόιτα), Τζορτζ Ντατόρου, Ισμαϊλ Μπα (105΄ Σάββας Χρίστου), Κούλης Παύλου (76΄ Χρίστος Παναγιώτου).
Στην ημιτελική φάση ο ΑΠΟΕΛ απέκλεισε την Ομόνοια με 3-3 και 3-1 και η ΑΕΚ την ΑΕ Πάφου με το εκτός έδρας γκολ (1-1 και 0-0).